Malgré sa petite taille avec 20.000 habitants environ, Lamu possède pas moins de trois musées, sans compter le fort.
Le musée principal, situé face au front de mer, présente l'histoire des habitants de Lamu, de ses bateaux et de ses coûtumes. On peut y voir notamment un magnifique instrument de musique dénommé siwa et qui était utilisé autrefois lors des cérémonies importantes comme les mariages.